Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAMBPL1Q96FJ0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAMBPL1Q96FJ0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAMBPL1Q96FJ0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAMBPL1Q96FJ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAMBPL1Q96FJ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAMBPL1Q96FJ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAMBPL1Q96FJ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAMBPL1Q96FJ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAMBPL1Q96FJ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAMBPL1Q96FJ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms