Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPTQ96BT3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms