Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCOLN3Q8TDD5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCOLN3Q8TDD5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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