Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms