Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP9Q8IXQ6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms