Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC83Q8IWF9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms