Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSSK4Q6SA08 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms