Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1CQ15572 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms