Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
EEA1Q15075 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
EEA1Q15075 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
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