Protein–RNA interactions for Protein: Q15053

KIAA0040, Uncharacterized protein KIAA0040, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0040Q15053 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0040Q15053 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.33■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms