Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
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