Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIGQ13278 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIGQ13278 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIGQ13278 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RIGQ13278 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIGQ13278 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIGQ13278 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIGQ13278 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIGQ13278 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIGQ13278 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIGQ13278 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIGQ13278 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIGQ13278 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIGQ13278 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIGQ13278 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIGQ13278 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIGQ13278 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIGQ13278 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIGQ13278 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIGQ13278 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIGQ13278 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIGQ13278 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RIGQ13278 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIGQ13278 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIGQ13278 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIGQ13278 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIGQ13278 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIGQ13278 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIGQ13278 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIGQ13278 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIGQ13278 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIGQ13278 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIGQ13278 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIGQ13278 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIGQ13278 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIGQ13278 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIGQ13278 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIGQ13278 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIGQ13278 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIGQ13278 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIGQ13278 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIGQ13278 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIGQ13278 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIGQ13278 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIGQ13278 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIGQ13278 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIGQ13278 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIGQ13278 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIGQ13278 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIGQ13278 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIGQ13278 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIGQ13278 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIGQ13278 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIGQ13278 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIGQ13278 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIGQ13278 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIGQ13278 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIGQ13278 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIGQ13278 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIGQ13278 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIGQ13278 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIGQ13278 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIGQ13278 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIGQ13278 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIGQ13278 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIGQ13278 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIGQ13278 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIGQ13278 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIGQ13278 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIGQ13278 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIGQ13278 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIGQ13278 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIGQ13278 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIGQ13278 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIGQ13278 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIGQ13278 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIGQ13278 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIGQ13278 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIGQ13278 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIGQ13278 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIGQ13278 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIGQ13278 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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