Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSTF3Q12996 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms