Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms