Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCP4P48539 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCP4P48539 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCP4P48539 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCP4P48539 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCP4P48539 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCP4P48539 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCP4P48539 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCP4P48539 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCP4P48539 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCP4P48539 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCP4P48539 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCP4P48539 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCP4P48539 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCP4P48539 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCP4P48539 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCP4P48539 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCP4P48539 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCP4P48539 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCP4P48539 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCP4P48539 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCP4P48539 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCP4P48539 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCP4P48539 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCP4P48539 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCP4P48539 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCP4P48539 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCP4P48539 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCP4P48539 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCP4P48539 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCP4P48539 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCP4P48539 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCP4P48539 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCP4P48539 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCP4P48539 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCP4P48539 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCP4P48539 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCP4P48539 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCP4P48539 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCP4P48539 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCP4P48539 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCP4P48539 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCP4P48539 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCP4P48539 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCP4P48539 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCP4P48539 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCP4P48539 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCP4P48539 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCP4P48539 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCP4P48539 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCP4P48539 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCP4P48539 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCP4P48539 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCP4P48539 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCP4P48539 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCP4P48539 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCP4P48539 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCP4P48539 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCP4P48539 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCP4P48539 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCP4P48539 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCP4P48539 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCP4P48539 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCP4P48539 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCP4P48539 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCP4P48539 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCP4P48539 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCP4P48539 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCP4P48539 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCP4P48539 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCP4P48539 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCP4P48539 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCP4P48539 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms