Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA3P42263 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms