Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNFP41002 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNFP41002 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNFP41002 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNFP41002 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNFP41002 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNFP41002 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNFP41002 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNFP41002 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNFP41002 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNFP41002 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNFP41002 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNFP41002 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNFP41002 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNFP41002 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNFP41002 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNFP41002 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNFP41002 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNFP41002 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNFP41002 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNFP41002 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNFP41002 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNFP41002 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNFP41002 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNFP41002 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNFP41002 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNFP41002 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNFP41002 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNFP41002 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNFP41002 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNFP41002 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNFP41002 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNFP41002 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNFP41002 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNFP41002 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNFP41002 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNFP41002 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNFP41002 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNFP41002 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNFP41002 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNFP41002 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNFP41002 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNFP41002 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNFP41002 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNFP41002 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNFP41002 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNFP41002 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNFP41002 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNFP41002 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNFP41002 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNFP41002 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNFP41002 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNFP41002 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNFP41002 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNFP41002 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNFP41002 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNFP41002 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNFP41002 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNFP41002 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNFP41002 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNFP41002 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNFP41002 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNFP41002 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNFP41002 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNFP41002 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNFP41002 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNFP41002 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNFP41002 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNFP41002 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNFP41002 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNFP41002 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNFP41002 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNFP41002 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNFP41002 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNFP41002 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNFP41002 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNFP41002 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNFP41002 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNFP41002 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNFP41002 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNFP41002 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNFP41002 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNFP41002 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNFP41002 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNFP41002 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNFP41002 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNFP41002 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNFP41002 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNFP41002 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNFP41002 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNFP41002 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNFP41002 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNFP41002 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNFP41002 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNFP41002 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNFP41002 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNFP41002 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNFP41002 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNFP41002 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNFP41002 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms