Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH5P33151 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH5P33151 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH5P33151 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH5P33151 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH5P33151 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH5P33151 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH5P33151 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH5P33151 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH5P33151 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH5P33151 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH5P33151 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH5P33151 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH5P33151 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH5P33151 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH5P33151 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH5P33151 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH5P33151 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH5P33151 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH5P33151 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH5P33151 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH5P33151 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH5P33151 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH5P33151 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH5P33151 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH5P33151 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH5P33151 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH5P33151 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH5P33151 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH5P33151 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH5P33151 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH5P33151 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH5P33151 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH5P33151 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH5P33151 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH5P33151 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH5P33151 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH5P33151 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH5P33151 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH5P33151 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH5P33151 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH5P33151 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH5P33151 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH5P33151 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH5P33151 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH5P33151 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH5P33151 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH5P33151 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH5P33151 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH5P33151 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH5P33151 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH5P33151 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH5P33151 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH5P33151 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH5P33151 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH5P33151 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH5P33151 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH5P33151 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH5P33151 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH5P33151 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH5P33151 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH5P33151 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH5P33151 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH5P33151 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH5P33151 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH5P33151 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH5P33151 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH5P33151 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH5P33151 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH5P33151 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH5P33151 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH5P33151 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH5P33151 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH5P33151 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH5P33151 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH5P33151 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH5P33151 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH5P33151 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH5P33151 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH5P33151 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH5P33151 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH5P33151 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH5P33151 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH5P33151 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH5P33151 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH5P33151 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH5P33151 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH5P33151 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH5P33151 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH5P33151 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH5P33151 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH5P33151 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH5P33151 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH5P33151 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH5P33151 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH5P33151 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH5P33151 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH5P33151 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH5P33151 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH5P33151 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms