Protein–RNA interactions for Protein: P21796

VDAC1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1P21796 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms