Protein–RNA interactions for Protein: O60635

TSPAN1, Tetraspanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1O60635 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN1O60635 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN1O60635 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN1O60635 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN1O60635 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN1O60635 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms