Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCP110O43303 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCP110O43303 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCP110O43303 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCP110O43303 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCP110O43303 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCP110O43303 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCP110O43303 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCP110O43303 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCP110O43303 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCP110O43303 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCP110O43303 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCP110O43303 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCP110O43303 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCP110O43303 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCP110O43303 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCP110O43303 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCP110O43303 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCP110O43303 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCP110O43303 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCP110O43303 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCP110O43303 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCP110O43303 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCP110O43303 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCP110O43303 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCP110O43303 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCP110O43303 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCP110O43303 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCP110O43303 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCP110O43303 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCP110O43303 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCP110O43303 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCP110O43303 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCP110O43303 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCP110O43303 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCP110O43303 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCP110O43303 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCP110O43303 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCP110O43303 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCP110O43303 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCP110O43303 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCP110O43303 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCP110O43303 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCP110O43303 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCP110O43303 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCP110O43303 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCP110O43303 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCP110O43303 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCP110O43303 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCP110O43303 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCP110O43303 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCP110O43303 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCP110O43303 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCP110O43303 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCP110O43303 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCP110O43303 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCP110O43303 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCP110O43303 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCP110O43303 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCP110O43303 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCP110O43303 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCP110O43303 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCP110O43303 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCP110O43303 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCP110O43303 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCP110O43303 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCP110O43303 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCP110O43303 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCP110O43303 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCP110O43303 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCP110O43303 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCP110O43303 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCP110O43303 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCP110O43303 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCP110O43303 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCP110O43303 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCP110O43303 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCP110O43303 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCP110O43303 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCP110O43303 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCP110O43303 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCP110O43303 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCP110O43303 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCP110O43303 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCP110O43303 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCP110O43303 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCP110O43303 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCP110O43303 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCP110O43303 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCP110O43303 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCP110O43303 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCP110O43303 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCP110O43303 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCP110O43303 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCP110O43303 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCP110O43303 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCP110O43303 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCP110O43303 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCP110O43303 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCP110O43303 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms