Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3KRW8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3KRW8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3KRW8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3KRW8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3KRW8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3KRW8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3KRW8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3KRW8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3KRW8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3KRW8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3KRW8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KRW8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KRW8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KRW8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KRW8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KRW8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KRW8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KRW8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KRW8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KRW8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KRW8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KRW8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KRW8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KRW8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KRW8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KRW8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KRW8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KRW8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KRW8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3KRW8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3KRW8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3KRW8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3KRW8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3KRW8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3KRW8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3KRW8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3KRW8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3KRW8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3KRW8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3KRW8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3KRW8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3KRW8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3KRW8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3KRW8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3KRW8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3KRW8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3KRW8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3KRW8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3KRW8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3KRW8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3KRW8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3KRW8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3KRW8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
J3KRW8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3KRW8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3KRW8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
J3KRW8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
J3KRW8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
J3KRW8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
J3KRW8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
J3KRW8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
J3KRW8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KRW8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KRW8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KRW8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KRW8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KRW8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KRW8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KRW8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KRW8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KRW8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KRW8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KRW8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KRW8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KRW8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KRW8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KRW8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KRW8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KRW8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KRW8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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