Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3BA8MYP8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms