Protein–RNA interactions for Protein: A6NN73

GOLGA8CP, Golgin subfamily A member 8C, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8CPA6NN73 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8CPA6NN73 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms