Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms