Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD3Q9Y3P4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDD3Q9Y3P4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.4 ms