Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA12Q9UN75 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms