Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms