Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms