Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLK3Q9C098 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLK3Q9C098 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLK3Q9C098 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLK3Q9C098 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DCLK3Q9C098 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DCLK3Q9C098 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DCLK3Q9C098 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCLK3Q9C098 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms