Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms