Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED9Q9BVK6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms