Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms