Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERGIC2Q96RQ1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms