Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC82Q8N4S0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms