Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKAP1Q86WV1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms