Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NLRP13Q86W25 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP13Q86W25 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms