Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms