Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX04

CWC27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC27Q6UX04 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC27Q6UX04 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC27Q6UX04 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC27Q6UX04 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC27Q6UX04 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC27Q6UX04 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC27Q6UX04 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC27Q6UX04 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC27Q6UX04 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC27Q6UX04 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC27Q6UX04 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC27Q6UX04 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC27Q6UX04 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC27Q6UX04 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC27Q6UX04 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC27Q6UX04 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC27Q6UX04 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC27Q6UX04 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC27Q6UX04 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CWC27Q6UX04 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC27Q6UX04 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms