Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms