Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC181Q5TID7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms