Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms