Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL24A1Q17RW2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms