Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIGQ13278 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIGQ13278 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIGQ13278 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIGQ13278 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIGQ13278 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIGQ13278 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIGQ13278 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIGQ13278 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIGQ13278 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIGQ13278 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIGQ13278 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIGQ13278 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIGQ13278 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIGQ13278 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIGQ13278 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIGQ13278 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIGQ13278 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIGQ13278 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIGQ13278 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIGQ13278 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIGQ13278 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIGQ13278 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIGQ13278 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIGQ13278 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIGQ13278 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIGQ13278 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIGQ13278 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIGQ13278 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIGQ13278 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIGQ13278 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIGQ13278 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIGQ13278 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIGQ13278 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIGQ13278 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIGQ13278 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIGQ13278 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIGQ13278 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIGQ13278 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIGQ13278 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIGQ13278 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIGQ13278 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIGQ13278 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RIGQ13278 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIGQ13278 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIGQ13278 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIGQ13278 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIGQ13278 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIGQ13278 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIGQ13278 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RIGQ13278 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIGQ13278 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIGQ13278 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RIGQ13278 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIGQ13278 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIGQ13278 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIGQ13278 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIGQ13278 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIGQ13278 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIGQ13278 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIGQ13278 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIGQ13278 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIGQ13278 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIGQ13278 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIGQ13278 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIGQ13278 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIGQ13278 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIGQ13278 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIGQ13278 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIGQ13278 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RIGQ13278 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RIGQ13278 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RIGQ13278 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RIGQ13278 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIGQ13278 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIGQ13278 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIGQ13278 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIGQ13278 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIGQ13278 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIGQ13278 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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