Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRSF5Q13243 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
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