Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC36.86■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC36.83■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
GRIN2AQ12879 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC36.82■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
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