Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms