Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms