Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms