Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX5P78411 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX5P78411 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX5P78411 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX5P78411 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX5P78411 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX5P78411 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX5P78411 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX5P78411 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX5P78411 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX5P78411 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX5P78411 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX5P78411 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX5P78411 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX5P78411 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX5P78411 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX5P78411 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX5P78411 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX5P78411 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX5P78411 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX5P78411 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX5P78411 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX5P78411 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX5P78411 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX5P78411 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX5P78411 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX5P78411 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX5P78411 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX5P78411 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX5P78411 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX5P78411 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX5P78411 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX5P78411 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX5P78411 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX5P78411 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX5P78411 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX5P78411 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX5P78411 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX5P78411 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX5P78411 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX5P78411 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX5P78411 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX5P78411 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX5P78411 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX5P78411 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX5P78411 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX5P78411 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX5P78411 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX5P78411 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX5P78411 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX5P78411 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX5P78411 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX5P78411 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX5P78411 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX5P78411 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX5P78411 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX5P78411 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX5P78411 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX5P78411 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX5P78411 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX5P78411 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX5P78411 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX5P78411 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX5P78411 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX5P78411 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX5P78411 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX5P78411 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX5P78411 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX5P78411 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX5P78411 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX5P78411 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX5P78411 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX5P78411 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX5P78411 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX5P78411 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX5P78411 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX5P78411 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX5P78411 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX5P78411 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX5P78411 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX5P78411 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX5P78411 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX5P78411 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX5P78411 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX5P78411 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX5P78411 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX5P78411 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX5P78411 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX5P78411 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX5P78411 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX5P78411 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX5P78411 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX5P78411 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX5P78411 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX5P78411 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX5P78411 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX5P78411 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX5P78411 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX5P78411 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX5P78411 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms